DNA结构是由基于特定蛋白质序列及其顺序的空间规则决定的

　　DNA的三维结构是由一系列基于特定蛋白质序列及其顺序的空间规则决定的。这是米兰理工大学计算机科学与工程专业的博士生Luca Nanni与同一所大学的Stefano Ceri教授和奈梅亨大学的Colin Logie教授最近在《基因组生物学》上发表的一项研究的发现。

　　该研究的第一作者卢卡·南尼说:“我们的研究最大的创新在于确定了CTCF蛋白处置的精确规则。CTCF语法的美丽和简单向我们展示了自然和进化是如何产生规律和令人难以置信的巧妙和功能系统的。”

　　如果完全展开，DNA分子大约有两米长，它通过一个复杂的系统将自己包裹起来，以保持其可接近性和正确的读数，从而驻留在细胞核中。在基因组的三维结构研究中至关重要的是拓扑结构域，它被认为聚集了具有相似作用和行为的DNA区域。

　　例如，具有相似功能的基因可能位于相同的拓扑结构域。南尼继续说道:“我们专注于编码CTCF蛋白的一些特定DNA序列。”

　　“这种蛋白质分离出在不同拓扑结构域之间形成屏障的DNA部分。在计算机模拟的帮助下，并根据这些蛋白质的方向建立了一个分类模型，我们发现了它们沿着DNA序列排列的惊人规律。”研究表明，这些DNA序列的取向和顺序使重建拓扑结构域成为可能。人类基因组的压缩遵循一种“语法”逻辑，包括CTCF序列、方向和它们之间的距离。